壹、退撫基金收繳、撥付等業務管理
一、 依法辦理退撫基金收繳及撥付，妥慎管理退撫基金
核算機關（構）、學校及軍事單位應繳基金費用與實際繳納費用是否相符，並維持參加基金人員基本資料之正確常新，作為各類退撫撥付給與依據。受理各機關（構）、學校及軍事單位申請補繳基金費用案件，審核申請函及所附證明文件，資格符合且證明文件齊全者，核算應繳基金費用本息後發函機關（構）、學校及軍事單位轉發當事人依限繳納。
依主管機關核定之新制退撫給與案件，檢查核定資料與繳納基金費用經歷，於規定時程如期完成。定期退撫給與發放前與相關機關比對查核領受資格，並與管理會收繳資料比對查核，避免溢撥、誤撥情事發生，於既定時程及時撥付各類人員。
二、 研修基金管理相關法規
基金管理會為使相關法規契合實務運作需要，適時檢討研修相關法規，並配合公務人員退休資遣撫卹法及公立學校教職員退休資遣撫卹條例，於107年6月29日訂定退撫基金撥補繳費用辦法及修正基金管理會撥付新制年資退撫給與作業要點，使基金收支管理更有效率。
三、 提高基金收支作業效率，維護行政服務品質
基金管理會依法定期程辦理基金收支事項，透過公教人員退撫查驗平臺取得相關查驗資料，並參考發放機關查註資料，簡化新制定期給與領受人資格查驗作業。此外配合軍公教人員定期退撫給與改按月發給政策，於基金管理會網站增設退撫給與支領紀錄查詢下載列印功能，提供領受人多元查詢服務。又因應年金改革，依新退撫法令規定及重新審定金額，如期順利於107年7月1日辦理各項新制退撫給與發放。
貳、退撫基金財務運用
一、 增列基金運用項目，增加多元投資途徑
為增加運用彈性及因應未來投資所需，自103年9月迄今，基金管理會依基金管理條例第5條第1項第5款之規定，研擬增列「國內外上市、上櫃權益證券」及「私募權益證券、黃金存摺及其他另類資產」等投資項目，業經104年3月26日考試院第28次院會審議通過，行政院並於同年6月24日以院授人給字第1040038218號函同意增列。
二、 配合實務運作，研修委託經營辦法及相關投資作業規定
有鑑於金融情勢瞬息萬變，為使委託經營績效管理更具彈性，基金管理會業於104年及108年研修「公務人員退休撫卹基金委託經營辦法」，並適時檢討研修財務內部作業規範，以建立更為符合實際業務運作之作業程序。自103年9月迄今，已陸續修正「公務人員退休撫卹基金國內上市(上櫃)公司股票及指數股票型基金投資作業規定」、「公務人員退休撫卹基金國內外債券投資作業規定」，並增訂「公務人員退休撫卹基金國外私募基金投資作業規定」等。
三、 增加國外委託類型及績效參考指標，分散投資風險
國外委託經營業務於103年度辦理「基礎建設股票型」及「不動產股票型」、105年度辦理「多元資產型」，106年度辦理國外委託時更納入「總報酬固定收益型」，委託方式增加另類投資型及固定收益型之投資管理風格，藉由委託類型多元化、投資區域分散化及委託風格之靈活化，俾利降低風險並提昇基金收益。
在績效參考指標部分，因應新的委託類型，陸續新增「道瓊Brookfield全球基礎建設指數」、「富時歐洲/北美不動產協會全球指數」、「美元三個月倫敦同業拆放利率」、「美元三個月國庫券收益率指標」等績效參考指數，期能與世界各地經濟產生連結，帶動經營策略彈性化與國際化。
四、 定期辦理退撫基金精算作業，審慎評估財務負擔能力
我國公務人員退撫新制自84年7月1日起施行迄今已24年餘，基金管理會基於善良管理人之職責，為期儘早瞭解在現行收支體制下，基金之長期（指未來五十年內）財務負擔狀況，業依基金管理條例規定採每3年精算1次之原則，迄今已委託專業精算機構辦理7次精算作業，精算結果並提報各相關主管機關，作為未來調整提撥費率之參考依據。
參、退撫基金風控機制
加強基金內部稽核，確保基金安全
為落實基金收支、管理及運用各項業務之內部控制，降低發生弊端之機率，基金管理會依據各年度稽核作業計畫，持續辦理國內外委託經營受託機構與保管銀行之稽核與監控，並加強內部稽核，以確保基金永續經營。
肆、退撫基金資訊化管理
一、 導入符合國際會計準則(IFRS)基金財務會計資訊系統
為配合導入國際財務報導準則(IFRS)需要，使基金會計制度與國際接軌，基金管理會規劃以2階段4期進行符合國際財務報導準則(IFRS)相關資訊系統之全面更新作業，並於104年完成全案建置，使財務風險透明化，提高退撫基金財務會計之公信力。
二、 配合年金改革進行各項系統功能增修
因應退撫給與按月發放及新修訂退休資遣撫卹法之施行，基金管理會於107年全面調整現行基金業務資訊系統，辦理育嬰留職停薪人員基金費用補繳及退撫給與撥付系統之相關程式增修及調整作業，及時配合法規實施時程順利上線並如期完成基金費用收繳以及發放各類給與事宜。
三、 強化資訊安全管理
為確保所有人員遵循資訊安全相關規範，強化對資訊作業安全之警覺性、參與感與行動力，以降低資安風險，基金管理會除持續推動、維護及更新資訊安全管理制度外，並參與行政院國家資通安全會報所辦理之網路攻防演練，分別於105年及107年榮膺績優機關殊榮。