於民國84年5月1日正式成立，隸屬銓敘部，掌理公務人員退休撫卹基金之收支、管理及運用事項，並受基金監理會監督。基金管理會採行委員制組織型態，置主任委員1人，由銓敘部部長兼任，綜理會務，副主任委員1人，襄理會務，委員13人至17人，由銓敘部遴聘國防部、財政部、教育部、行政院主計總處、行政院人事行政總處、臺北市政府、高雄市政府業務主管各1人及專家學者組成之，每月開會1次。另為應業務需要，得遴聘相關領域之專家學者若干人為顧問，聘期1年。為辦理該會掌理事項及執行委員會議各項決策事項，下設業務組、財務組、稽核組、資訊室、秘書室、人事室、主計室等單位，法定員額為88人。