管理會於84年5月1日正式成立，隸屬銓敘部，掌理有關公務人員退休撫卹基金之收支、管理及運用事項，並受監理會之監督。
管理會採行委員制組織型態，置主任委員一人，由銓敘部部長兼任，綜理會務，副主任委員一人，襄理會務，委員十三人至十七人，由銓敘部遴聘國防部、財政部、教育部、行政院主計處、行政院人事行政局、台灣省政府、台北市政府、高雄市政府業務主管各一人及專家學者組成之，每月開會一次。另為應業務需要，得遴聘相關領域之專家學者若干人為顧問，聘期一年。
為辦理管理會掌理事項及執行委員會各項決策事項，管理會法定員額訂為八十九人，下設業務組、財務組、稽核組、資訊室、秘書室、人事室、會計室等單位。
後於112年4月30日正式改制為公務人員退休撫卹基金管理局。